В 1999 года при Гимназии Свято-Алексиевской Пустыни был создан Кадетский Корпус.
В отдельные годы в Корпусе воспитывалось до 90 мальчиков с 5-го по 12-й класс. Их воспитанием занимаются офицеры-воспитатели.
Сегодня в Объединённый Святого Апостола Андрея Первозванного Кадетский Корпус Свято-Алексиевской Пустыни входят следующие подразделения:
Сухопутный Святого Благоверного Великого Князя Александра Невского Кадетский Корпус.
Морской Святого Праведного Воина Фёдора Ушакова Кадетский Корпус.
Казачий взвод.
Спортивный взвод.
Духовой оркестр.
Кадеты Кадетского Корпуса Свято-Алексиевской Пустыни многократно становились победителями Всероссийской военно-спортивной игры «Победа», Всероссийской военно-спортивной игры «Казачий сполох», Всероссийской Спартакиады допризывной казачьей молодежи, занимали призовые места на всероссийских соревнованиях «Юный водник».
Кадеты участвуют в экспедициях «Вахта памяти» по захоронению павших в боях во время Великой Отечественной Войны советских воинов.Кадетский Корпус Свято-Алексиевской Пустыни посещают генералы и адмиралы, Герои Советского Союза и Герои России, ветераны боевых действий, старшие офицеры и члены ветеранских организаций.
Воспитанники Кадетского Корпуса Свято-Алексиевской Пустыни участвуют в праздничных, юбилейных, воинских мероприятиях в Переславле, Ярославле и Ярославской области, Санкт-Петербурге, Москве и Московской области, в других регионах.
Духовой оркестр является структурным подразделением Кадетского Корпуса — это единственный детский (юношеский) духовой оркестр Ярославской области.
Кадетский Корпус Свято-Алексиевской Пустыни дает мальчишкам всестороннюю подготовку — это знание устава, строевые приемы, хорошие манеры, военно-прикладные дисциплины, конные занятия, бальные танцы, интеллектуальные олимпиады — всё, что необходимо будущему защитнику Отечества.